短链脂肪酸是一类碳链上的碳原子数小于6的有机脂肪酸，具有较强的挥发性，也被称作挥发性脂肪酸。它们是厌氧消化过程的重要中间产物，以近端结肠含量最高。短链脂肪酸在肠道内以盐的形式存在，是肠道上皮细胞的重要能源物质，也是游离脂肪酸受体的天然配体。短链脂肪酸具有维持肠道内电解质平衡，诱导癌细胞分化和凋亡，调控基因表达等作用。
短链脂肪酸的主要种类包括丁酸、丙酸、乙酸等，这些脂肪酸主要由碳水化合物经肠道菌群发酵产生，占短链脂肪酸的90%~95%，是肠道中主要的短链脂肪酸，在调控肠道营养物质吸收、激素产生及能量代谢过程中发挥重要作用。此外，异丁酸、异戊酸、戊酸等主要由蛋白质经肠道菌群发酵产生。
短链脂肪酸（scfas）也称为挥发性脂肪酸，主要作用包括能降低肠道pH值，抑制有害菌生长，促进肠道蠕动，维持电解质平衡，提高能量代谢率等。
短链脂肪酸种类：乙酸、丙酸、丁酸、异丁酸、戊酸、异戊酸、己酸。
检测方法：气相色谱（GC）或气相质谱联用（GC-MS）
样品提取：精确称取 0.2000g 左右样品于棕色离心管中，加入 2ml 20%磷酸水，振荡混匀。低温匀浆 3min。4 度低温超声 60min，4度，13000r/min 离心 10min。
然后取上清液 0.5ml 过 0.45 μm 滤膜待测。
测试条件：色谱条件如下：用 N2作为载气，色谱柱：安捷伦 DB-23(60m× 0.25mm×0.25μm)，进样口温度为：270℃，检测器温度：280℃，H2流量：50ml/min，N2流量 30ml/min,空气流量：500ml/min，分流比：50:1 柱箱：程序升温 初始温度 80℃保持 4min,然后以 10℃/min 升到 180℃，保持 1min，流量：2ml/min，进样量： 2μL。
送样要求：
动物组织 0.2g
植物组织 0.5g
叶片0.1g
发酵液0.3ml
灌洗液0.3ml
血清、血浆 0.3ml
肠道内容物 0.2g
粪便 0.5g
饲料0.1g
细胞 10*7个
样品需放-80冰箱保存，送样需要干冰运输。