植物叶片中的脱落酸（简称ABA）是一种具有倍半萜骨架的植物激素，含有羧基（-COOH）、羟基（-OH）、α,β-不饱和羰基（C=O与C=C共轭），具有紫外吸收的特征。脱落酸的等电点pKa≈4.87，如果用液相色谱，缓冲盐可用磷酸盐，调pH值到3左右；如果用液相串联质谱，缓冲盐用甲酸，以维持良好的峰形。缓冲盐的浓度常在10-50mM，以保持良好的缓冲能力。
在干旱、盐碱胁迫等逆境下，植物叶片可快速合成脱落酸，关闭叶片的气孔通道，减少水分蒸腾。它的作用机制是，细胞内离子（K+、Cl-等）外流，细胞失去水分，膨压降低，气孔逐渐减小直到关闭。
取样后的植物叶片要经过液氮冷冻，避免降解。前处理的过程中，用液氮将叶片研磨成细小的粉状，细胞结构破坏，脱落酸就会从细胞液中释放出来。细胞液中的成分比较复杂，需要用80%甲醇或异丙醇等溶解脱落酸，在低温避光的环境中操作抑制酶的活性。在提取的过程中，将粉末和预冷提取液混合，超声或涡旋振荡，离心。用有机溶剂（如氯仿、石油醚）和提取液混合，通过液液萃取将脱落酸留在水相，通过氮吹浓缩，用甲醇或乙腈复溶，0.22um膜过滤。
HPLC采用反相C18色谱柱，用甲醇-水或乙腈-水为流动相，0.1%甲酸改善峰形，梯度洗脱。流速1ml/min，柱温30-35℃（储存条件下4℃，样品在色谱柱的停留时间很短）。LC-MS/MS测定脱落酸，采用负离子模式进行检测。脱落酸的分子结构中含有羧基（-COOH），在质谱电离过程中容易失去质子形成带负电的离子，在负离子模式下能获得更高灵敏度和稳定的信号。液相部分采用乙腈和0.1%甲酸水为流动相，梯度洗脱（从高比例水相开始，逐步降低，然后恢复初始流动相），用粒径更小、更短的色谱柱（2.1*100mm，1.7um），分离度高，分析时间短。
电喷雾电离（ESI）电压-4500V，温度450℃。采用多反应监测模式（MRM），选择脱落酸定量离子对（263/153），定性离子对（263/219或204）。根据出峰的情况，调节气帘气、碰撞气、Gas1和Gas2压力。通过脱落酸标准品的浓度和峰面积，绘制标准曲线（5-7个点），得到回归方程，根据样品峰面积计算含量。